Дело как оказалось было в том, что при зачистке pkg/lists/ я удалил файл docs, который в свою очередь требовался в profiles/Makefile.in. После удаления из profiles/Makefile.in строчки pkg/lists/docs, образ начал нормально собираться. За устроенный разбор полетов огромнейшее спасибо Ленару Шакирову aka snejok@!