[Comm] апдейт и ява

[Serge]

Доброго дня.
Позавчера обновлялся.
вот что выдал апдейт (АЛ сервер 4)

Получено 217MB за 52m37s (68,8kB/s).
Совершаем изменения...
Preparing...                 
########################################################################################## 

[100%]
 1: fonts-ttf-java-1.6.0-sun
########################################################################################## 

[  3%]
 2: java-common              
########################################################################################## 

[  6%]
 3: java-1.6.0-sun           
########################################################################################## 

[  9%]
/usr/lib/jvm/jre-sun    /usr/lib/jvm/jre-1.6.0-sun      
/usr/lib/jvm/jre-1.6.0-sun/bin/java
errors:
 same alternative already registered as a master
 4: java-1.6.0-sun-javaws    
########################################################################################## 

[ 12%]
/usr/lib/jvm/jre-sun    /usr/lib/jvm/jre-1.6.0-sun      
/usr/lib/jvm/jre-1.6.0-sun/bin/java
errors:
 same alternative already registered as a master
 5: java-1.5.0-sun           
########################################################################################## 

[ 16%]
/usr/bin/javaws
/usr/lib/jvm/java-1.6.0-sun-1.6.0.03/jre/javaws/javaws-alt      
/usr/lib/jvm/jre-1.6.0-sun/bin/java
errors:
 same alternative already registered as a master

итд

Я по ошибке написал в сизиф, мне посоветовали от рута выполнить 
"Сделайте из под рута alternatives-update"
сделал.
Теперь при запуске ява приложения получаю вылет  с кратким сообщением на 
отсутствие jdkhome

Как я понял, это вызвано отстутсвием каталога  в /usr/lib/jvm/java
Как это исправить?